Constituido por el material biológico colectado, preservado y estudiado por el Dr. Spegazzini, la colección se encuentra citada y expuesta en más de 200 publicaciones científicas de botánica y fitopatología. Reúne alrededor de 40.000 ejemplares dentro de los cuales 4.066 son especies tipo acompañadas por ilustraciones científicas legadas por Spegazzini.
De inestimable valor e imprescindible cuando se inicia el estudio de cualquier entidad taxonómica, es conocido e identificado nacional e internacionalmente con la sigla LPS. Dentro de este Fungario debe mencionarse la presencia de la colección de Laboulbeniomycetes que inició el Dr. Spegazzini, y que consta de aproximadamente 150 preparados para microscopía.
Actualmente se encuentra en proceso de digitalización de imágenes. Como todo repositorio de material biológico constituye un elemento que documenta y conserva parte del patrimonio nacional de la diversidad fúngica.